南京地铁3号线的运营时间为05：50到23：10，标志色为绿色。
林场站
星火路站：
定山寺（4号口出，步行283米后乘坐d61路公交到沿山大道•珍珠街站【5站】下车，步行2公里抵达）
东大成贤学院站：
泰山寺（4号口出，步行193米后乘坐664路公交到泰山庙站【4站】下车，步行61米抵达）
可口可乐博物馆（3号口出，步行163米后乘坐d4路到南大金陵学院南门东站【3站】下车，步行440米后抵达）
泰冯路站：可换乘地铁s8号线
天润城站
柳洲东路站：
四方当代美术馆（2号口出，步行341米后乘坐694路公交到珍珠泉总站【18站】下车，步行1.3公里抵达）
上元门站：
达摩古洞（2号口出，步行262米后乘坐307路公交到五马渡站【4站】下车，步行836米）
大桥公园（1号口出，步行203米后乘坐1路公交到南堡公园站【1站】下车，步行42米抵达）
和记洋行旧址（1号口出，步行203米后乘坐1路公交到南堡公园站【1站】下车，步行723米抵达）
五塘广场站：
幕燕风景名胜区（1号口出，步行1.1公里抵达）
小市站
南京站：可换乘地铁1号线
南京林业大学•新庄站：
情侣园（1号口出，步行456米抵达）
南京林业大学（3号口出，步行160米抵达）
栖霞山（1号口出，步行305米后乘坐206路公交到栖霞五福家园站【23站】下车，步行733米抵达）
鸡鸣寺站：可换乘地铁4号线
古鸡鸣寺（5号口出，步行611米抵达）
东南大学（6号口出，步行486米抵达）
和平公园（4号口出，步行258米抵达）
浮桥站
大行宫站：可换乘地铁2号线
六朝博物馆（5号口出，步行642米抵达）
江宁织造博物馆（6号口出，步行108米抵达）
复园（5号口出，步行718米抵达）
孙中山雕像（5号口出，步行711米抵达）
天王府遗址（5号口出，步行564米抵达）
国立美术馆旧址（6号口出，步行342米抵达）
常府街站：
金陵刻经处（4号口出，步行574米抵达）
六朝宫城遗址（4号口出，步行718米抵达）
李鸿章祠堂（4号口出，步行898米抵达）
夫子庙站：
江南贡院（2号口出，步行541米抵达）
大成殿（3号口出，步行676米抵达）
东水关遗址公园（3号口出，步行1.6公里抵达）
武定门站：
芥子园文化展馆（2号口出，步行986米抵达）
雨花门站：
晨光1865科技创意产业园（4号口出，步行630米抵达）
南京永银钱币博物馆（4号口出，步行827米抵达）
卡子门站
大明路站
明发广场站
南京南站：可换乘地铁1号线、s1号线、s3号线
宏运大道站
胜太西路站：
百家湖博物馆（1号口出，步行518米抵达）
天元西路站
九龙湖站：
九龙湖公园（1号口出，步行111米抵达）
诚信大道站
东大九龙湖校区站：
秣陵杏花村（1号口出，步行217米后乘坐838路公交到东南大学路站【2站】下车，步行534米抵达）
秣周东路站：
上秦淮生态湿地公园（1号口出，步行689米抵达）
南京地铁3号线也是采用大小交路混跑的运行模式，大交路从林场站到秣周东路站，小交路从林场站到胜太西路站。
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