芒果是多年生、深根性果树。根系的生长活动、分布范围与地上部分的生长结果能力、寿命长短、树势、抗逆性和适应力都有着十分密切的关系，因此，根系是芒果整个机体的一个重要组成部分。
芒果根系包括主根、侧根与须根三大部分。主根（由种子中的胚根发育而成）和侧根是根系的骨架，故又称骨干根。其主要作用是支持和固定树体，运输养分、水分。须根是侧根末端细小的分枝，数量多，如头发粗细，生理上最活跃。新生须根是吸收水分、矿物质养分并将其转化为树体内需要的营养物质的主要部位，颜色浅，组织嫩。随着新生根不断生长，根系向外扩展，早先生长的须根颜色逐步变深，最后转为黑褐色，一部分自疏死亡。
芒果根系在土壤中的分布情况
芒果的主根和土壤中下层的根系，多垂直向下或近于垂直向下伸展，称为垂直根。其入土深度视品种、年龄、砧木、繁殖方法及土壤理化性状而异。芒果实生树和实生砧木嫁接的苗木，具有发达的主根，可垂直深入土壤深层，侧根层次分明，主根上每隔10~12厘米分布一轮（3~5条）侧根。芒果幼树移栽时切断主根后，可以从断口处长出多条侧根以代替主根垂直向下伸长。如果是用扦插或压条繁殖的苗木，根系是由茎上长出的不定根，无主根，根系分布深度则不如实生根系。生长在河边沙土高地上的数十年至上百年的实生树，垂直根可达8~10米深，而地下水位高的或粘土地，垂直根的生长就会受到限制，常根据地下水位的高度决定根系的深度。垂直根深入土壤下层，有利于固定植株、吸收水分和微量元素。沿着土壤表层水平生长的根系，称水平根，这类根对植株的养分供应极其重要，表层土壤疏松、肥沃，水分适度，则水平根发达，须根多，密度大。幼树水平根的生长速度低于垂直根，且分布范围小于树冠。随着年龄的增长，水平根生长速度加快，垂直根所占比例逐渐减少。入为限制幼树垂直根的生长，促进水平根的发展，有利于扩大树冠，使果树提早进入结果期。
