农田水利工程的管护是水利工作者经常谈论的问题，经验告诉我们，水利工程只有使用它，才能更好地管护它，也才能最大程度的发挥工程效益。就目前农田水利工程现状，按类别可分为灌溉机井、小型电灌站、渠系建筑物、蓄水涵闸、面上排涝沟、桥涵工程等；按建设年代统计，从上世纪六、七十年代至今天新建的工程都存在着。
农田水利工程的特点是单体工程小，类别多，分布散，使用功能各异，管理难度较大，各地的情况差异很大，但找到管护工程的好措施是我们共同的目标。
从对水利工程多年的管理情况来看，国有的、有专人管理的、经常使用的水利工程就能管护好、使用好，发挥效益；乡镇集体所有的、无管护主体的、管护责任不明的、不使用的工程就会被损毁。
为加强农田水利工程的管护，界首市政府于制定了《界首市人民政府关于印发界首市小型水利工程管理体制改革实施方案的通知》，按照文件精神及要求，对国有的水利工程，仍然由县级水行政管理部门承担，乡镇管理的由乡镇政府委托合作社对境内的小型农田水利工程实施管护。界首市水务局通过实践摸索出一套具体做法：
一是明确工程的管护目标和措施。按照“产权有归属，管理有载体，运行有机制，工程有效益”的总体要求来实现管护工程的目标。管护措施即“四个一”措施：每一个工程一份管护档案，一份管护协议，一个管护主体，一套管护机制。
二是建立管护组织，落实管护责任。按照管护目标的要求，任寨乡成立了“祥雨水利设施管理合作社”作为试点，又在邴集、靳寨2个乡分别成立水利灌溉专业合作社，建立健全水利管护专业合作组织，以后逐年实施。
三是摸清水利家底。摸清工程管护范围内的桥涵、塘坝、排涝河沟、小水闸、机电井、末级渠系、农村安全饮水工程等工程情况。以上工程要登记造册，建立档案，并有专人管理。
四是制定工程管护的具体要求。包括灌溉工程的机电井及渠系配套完好；除涝工程的沟河通畅，无毁坡种植现象；桥梁保护完好；农村安全饮水工程的安全供水保障，合理收费，服务群众等。
五是落实管护责任。成立水利合作组织的乡镇于12月底完成“两证一书”的发放工作，确立工程权属，明确管护主体，签订管护责任书，落实管护责任。
六是落实工程管护资金的筹措和使用。有项目实施的乡镇，依托项目建设平台，用项目建后管护资金将管护组织建立起来。合作社正常运行后，资金筹措主要来源于县级农田水利工程专项维修养护资金补贴10万元/年，同时，合作社也要进行自身经营创收。工程管护资金的使用，主要用于小型农田水利工程及设备的日常维修管护、必要的管护工具购置、村级水管员误工补助等。
七是强化考核监管。县级水务局要对水利工程管护合作组织的管护效果进行考核，实行奖优罚劣，并和管护经费补助挂钩。确保工程管护经费专款专用。
