在苹果近成熟时开始出现症状，贮藏期继续发展。病斑多发生在靠近萼凹的部分，而靠近果肩处则较少发生。病部果皮下的果肉先发生病变，而后果皮出现以皮孔为中心的圆形斑点。这种斑点，在绿色或黄色品种上呈浓绿色，在红色品种上则呈暗红色，而且病斑稍凹陷。后期病的部位果肉干缩，表皮坏死，会显现出凹陷的褐斑，深达果肉2—3毫米，有苦味。轻病果上一般有3—5个病斑，重的60—80个，遍布果面。
①苦痘病的发生与叶片、果实的钙比有关。比率上升，发病率增高。如叶片中的钙含量与果实中的钙含量比等于20—30，发病率为6.1%；等于50—60时，发病率为22.4%；等于70—80时，发病率为75%。
②果园土壤有机质含量高，碳氮比高，发病轻；沙地、低洼地发病重。地下水位高的沙地，根系主要分布层因出现渍水，铵态氮积累太多，发病重。前期土壤干旱，后期大量灌水均会降低果内钙的含量，加重病情。偏施、多施氮肥，特别是生长后期偏施氮肥，病情加重。
③幼果期和采收前降雨量大或频繁，病情加重，有些地区土壤并不缺钙，但仍有苦痘病发生，主要是由于土壤内盐基失衡，叶中的钙不能顺利转移到果实所致。
④该病的发生与品种、砧木、果树生长状况、土壤质地及栽培技术密切相关。在苹果各品种中，国光、生娘、祝光、青香蕉、赤龙、玉霞、元帅、金冠（幼树）、桔苹、旭、翠玉、秋花皮、伏花皮等较感病，红宝石贮藏期无苦痘病。同一品种，砧木不同，发病轻重不同。如接穗用国光、烟台沙果、福山小海棠发病轻；山定子砧发病重。同一品种中，幼树、旺树、结果少、果个大的含钙量低，发病重。
