全国二本土木工程专业好一点的大学有：清华大学、哈尔滨工业大学、浙江大学、大连理工大学、东南大学、河海大学、西南交通大学、湖南大学、天津大学等。
清华大学有结构工程、防灾减灾与防护工程、材料学博士点，并有土木工程一级学科博士学位授予权，结构工程（联合防灾减灾与防护工程）是国家重点学科。中国工程院院士2人，教授23人，副教授24人，讲师8人，目前在校本科生300多名，研究生200多名。
同济大学设有土木工程博士后流动站。桥梁工程学科为上海市“重中之重”重点学科，结构工程、岩土工程学科为上海市重点学科；桥梁与隧道工程、结构工程、岩土工程三个二级学科为全国重点学科。
这几个专业各有特长，都是很有发展前景的专业。
土木工程是土木类里的二级学科；水利工程、港口航道与海岸工程是水利类里的二级学科；船舶与海洋工程是海洋工程类里的二级学科。按传统的意见是土木工程，但按紧缺学科是船舶与海洋工程。不知你是哪个学校的，你又准备考研，建议你选择是你校的强势学科为上。对你今后的发展有好处。
供参考。
