首先，其实，建议你还是去华中的计算机，毕竟工程硕士和工学硕士还是有区别的，毕竟工程硕士现阶段来说还不是被相关的单位所重视，这事是一个很现实问题，可能在清华你学的东西要多，但大部分大部分单位还是认准全日制的硕士生，那相对来讲工程硕士就不那么能够得到单位的认可。
其次，如果你是在上了清华的学校划定的分数线的话，而没有上学院的线或者是在清华计算机面试的时被刷下来的话，这两种都有机会调剂到她的软件学院去。
第三，工程硕士学费一般较贵，不同的学校也有不同的收费标准，所以建议你向学校具体的咨询，另外，在软件学院也有可能是公费或者奖学金的情况，具体事宜还是要向学校相关部门人事咨询。
最后，至于你所说的落户、就业问题，落户只要不是在北京、上海等这些要求比较严格得地方一般都没有问题，至于会不会对工程硕士有限制，我个人感觉应该是会有一点，关键就是你和人事户口部门沟通了，就业只要你不是在国有企业，大部分企业是不会有太多的限制。除非你是在原来单位上班，这种情况是比较好的情况，人比较熟，而且上完工程硕士后，单位也承认学历，是很好的
个人观点，仅供参考
对清华的了解一些，清华软件学院今年统考录取工学硕士2个，工程硕士10个，接收外校推免58人，其中55人直硕（全部为工程硕士），3人直博，清华本校保研状况不太清楚。清华的软件工程的研究生招生数很少，难度大，初试考：①101思想政治理论②201英语一③301数学一④408计算机学科专业基础综合，初试工学和工程考的科目一样。区别只是分数线的不同，或者分数线相同，最后复试以后决定谁是工学谁是工程而已。招生量很少，规模小，而且培养模式工学和工程差别不大，加上清华信息学科很牛，所以清华的软件工程硕士不输其他大学的工学硕士。至于就业，网上有说软院是清华就业最牛的院系之一，信不信由你了。北大的话，貌似有个软微学院，招的人很多，基本都是工程硕士。而且貌似不在本部。这个你自己去了解下，我不打算帮你找了。
