生物信息学在基因组学中的应用
随着计算机科学、物理学、数学等与生命科学的相互渗透和交叉,生物信息学愈来愈显示出其重
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生物信息学是随着基因组测序数据迅猛增加而产生的一门新兴学科。人类基因组计划的顺利完成和新一代测序技术的发展推...
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毒理基因组学主要在基因组水平上研究机体对环境因子的应答反应,了解基因和环境交互作用在疾病发生中的作用。生物信息学...
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生物信息学已成为整个生命科学发展的重要组成部分,是生命科学研究的前沿领域。作...
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生物信息学(Bioinformatics)是将生物学与计算机科学、数学等相结合而形成的新兴学科。近年来,分子生物学的进步带动了生物信息学的发展,并将其应用到药用植物领域,为中药研究提供了新的研究手段。本研究将生物信息学应用到药用植物基因组、后基因组和分子鉴定研究,对其中的关键生物信息技术进行了开发、比较和分析。基因组是对药用植物进行系统的生物学研究的基础。本研究对药用植物基因组中的生物信息学技术和算法进行了研究。在基因组组装方面,基于重叠图的组装策略构建了基因组组装流程,并使用物理图谱进行组装结果验证和优化,以紫芝为例,构建得到48.9Mb的紫芝基因组,共12条染色体序列。在基因预测方面,使用基于隐马尔可夫模型的从头预测和基于证据的预测方法相结合的方式,提高了基因预测的准确性。在基因功能注释方面,使用Smith-Waterman算法和隐马尔可夫模型相结合的方法构建了基因功能注释流程,可搜索Nt、Nr、Swissprot、COG数...
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生物信息学是以计算机为工具,对大量的DNA和蛋白质等生物信息进行收集、储存、检索和分析的科学,目前已成为自然科学的核心领域之一。结合生物...
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