1000字范文,内容丰富有趣,学习的好帮手!
1000字范文 > 单细胞转录组专题研讨会第二期

单细胞转录组专题研讨会第二期

时间:2021-09-07 14:19:12

相关推荐

单细胞转录组专题研讨会第二期

单细胞转录组之前是跟常规转录组一起开课的,但后来因为涉及内容多,也需要更专业的讲解,8月份第一次单飞独自开课,邀请中科院单细胞分析算法开发博士倾力授课,一鸣惊人,取得了很好的效果。

现于11月29日-12月1日在北京鼓楼推出《单细胞转录组数据整合分析第二期》专题培训,在第一期基础上进一步精进提高,适合研究临床、动物、植物的科研工作者参加。

如果时间等不及,可以参加我们的线上视频课程,随时加入,随时开始。(购买之前联系我们,更有办法获得本次课程更新的视频)

关于学习生物信息学分析的重要性,请阅读《生物信息9天速成班—成为团队中不可或缺的人》。

课程简介

本课程一共3天,每天6节课,共18节课,全部课程均理论与实战结合(只要课上讲的都是可以带你自己实现的分析)。从分析平台搭建、Linux和R基础、图表解读和实战、单细胞转录组设计、分析标准流程、单细胞分型 (Cellranger, Seurat3, Scater, Monocle3, Scran),Marker基因鉴定,Pseudo-time分析,单细胞整合分析(CCA,Seurat Anchor, label transfer, )及功能富集分析及各类高级分析(WGCNA、通路图绘制等),和CNS级图片修改排版。3天时间,老司机带您完成自学需要3个月甚至是1年的崎岖之路,助力您真正玩转单细胞转录组分析。

课程大纲

每节课1小时一个主题,理论结合实战,学懂原理,实战实操,全是老司机多年经验和代码的无私分享。下面是课程安排,如11代表第一天第一节课,26代表第二天第六节课,41为两周后的线上集中视频答疑。

教程内容简介如下:

单细胞转录组技术介绍

单细胞转录组学研究技术介绍

单细胞转录组学实验设计和测序原则、注意事项

二代、三代测序过程和原理解析

单细胞转录组学文章案例分析

目标基因GSEA/GO富集分析

单细胞转录组分析

单细胞数据预处理和校正

细胞分型,PCA, TSNE, SC3聚类 (Seurat3, Monocle3, Scater)

单细胞发育演化分析

转录组常见图形在线绘制

单细胞Marker基因鉴定,差异分析和功能分析

单细胞数据整合分析、批次校正

单细胞数据可视化

绘制和理解单细胞分析常见图形

生信基础知识

Linux/Windows下Rstudio和Linux命令的使用

Linux/Windows下转录组分析流程的搭建

生物学家必要掌握的Shell和R语言基础知识。

(如果基础薄弱,报名付款成功后,可免费领取基础程序课,做好准备工作, 让程序成为我们的得力工具而不是学习新知识的绊脚石。)

单细胞系列教程

收藏 北大生信平台” 单细胞分析、染色质分析” 视频和PPT分享

Science:小鼠肾脏单细胞转录组+突变分析揭示肾病潜在的细胞靶标

10X单细胞测序分析软件:Cellranger,从拆库到定量

Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(一)- 引言

Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(二)- 实验平台

Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(三)- 原始数据质控

Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(四)- 文库拆分和细胞鉴定

Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(五)- STAR, Kallisto定量

Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(六)- 构建表达矩阵,UMI介绍

Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(七)- 导入10X和SmartSeq2数据Tabula Muris

Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(八)- Scater包输入导入和存储

Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(九)- Scater包单细胞过滤

Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(十)- Scater基因评估和过滤

Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(十一)- Scater单细胞表达谱PCA可视化

Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(十二)- Scater单细胞表达谱tSNE可视化

单细胞分群后,怎么找到Marker基因定义每一类群?

Science:通过单细胞转录组测序揭示玉米减数分裂进程 | 很好的单细胞分析案例

GO、GSEA富集分析一网打进

GSEA富集分析 - 界面操作

无需写代码的高颜值富集分析神器

去东方,最好用的在线GO富集分析工具

没钱买KEGG怎么办?REACTOME开源通路更强大

超简便的国产lncRNA预测工具LGC

我想做信号通路分析,但我就是不想学编程

这个只需一步就可做富集分析的网站还未发表就被CNS等引用超过350

定制内容

如果您看到文章中有哪些图或分析工作需要重现,也请提出,一起讲述。

如果您有其它关注的问题,也请报名时提出,把这次课程变成您的定制讲解

主讲教师

陈同,博士,毕业于中科院遗传与发育生物学研究所,生物信息专业博士,在Cell Stem Cell(IF=23.2,第一作者兼封面文章),Nucleic Acids Research,Stem Cells and Development等高水平杂志以第一作者或主要作者发表文章,运营有数万人关注的《生信宝典》微信公众号,给你不一样的学习生信体验。

刘永鑫,博士。毕业于东北农大微生物学专业。中科院遗传发育所获生物信息学博士学位,博士后出站留所工作,任宏基因组学实验室工程师,目前主要研究方向为宏基因组学数据分析与可重复计算。发表论文10余篇,SCI收录7篇,NBT和Science各一篇。7月创办“宏基因组”公众号,目前分享宏基因组、扩增子原创文章185篇,关注人数5万+,累计阅读千万次。

授课模式

本课程以讲解流程和实际操作为主,采用独创四段式教学,封装好的代码全部分享,随处可用:

第一阶段 3天集中授课;

第二阶段 自行练习2周;

第三阶段 在线直播答疑;

第四阶段 培训视频继续学习;

实现教-练-答-用四个环节的统一协调。

培训时间

-11-29 到 -12-1 (线下讲解实战)

每天早9点到晚6点,半封闭式教学 (最后1小时为集中讨论时间,最后一天会稍微提前一些,多留出时间讨论,也方便老师乘车返回)

报到时间:开课当天

授课地点

北京市西城区鼓楼附近

课程价格

截止 -11-10 4500 元/人

名额有限,每次课程报名满40人后自动关闭报名通道 (老学员不受限)

提供易汉博基因科技实习机会或工作机会

课程福利

座位按报名并缴费或预付款成功顺序从前到后龙摆尾式排序

赠送程序基础课一份 (http://bioinfo.)

多人 (N,10>N>1) 组团报名并同时缴费,每人还可减免N-1百元 (最高500)

赠送金士顿U盘一个(32G含培训数据和脚本)

附推荐语分享对应的招生信息到朋友圈,截图发到train@ 可获得200元生信宝典腾讯课堂课程优惠券(可拆分供多个课程使用)

注意事项*

需自备笔记本电脑,推荐使用win10系统(MAC也可),4G以上内存(推荐8G)。

课程实践根据需要会提供云计算平台

培训班所有数据,文档为内部资料,仅供参阅,未经允许不得翻印外传登刊

上课期间禁止录音,录像

成功付款的学员,若临时有紧急事情不能到来的,可申请延期,更换后续培训班;

也可申请退款

若临时有事不能参加,请提前联系。

开课前两周退报,预付款全退。

开课前两周内,预付款退800元,开课前一周内,预付款退500,开课前两天,预付款不退。

不可先延期再退款

更多课程的详细介绍,请扫描下方二维码。

复制以下链接/Training/ 或点击阅读原文跳转报名页,成为实验中不可或缺的人,赶快报名吧!

本内容不代表本网观点和政治立场,如有侵犯你的权益请联系我们处理。
网友评论
网友评论仅供其表达个人看法,并不表明网站立场。